全自動液體進樣器可以對任何樣品體系中的揮發性化合物進行簡單快速的色譜分析，使分析工作者大大減少了樣品處理的煩瑣的過程和時間。故障容易被發現，有時液相色譜儀系統出了故障而不能確定是否是進樣器故障，可以用手動進樣幾次，或用一臺好的全自動液體進樣器代替，如排除了故障，說明進樣器有了問題。不同廠商的進樣器差異很大，除一些共性故障外，較好查閱操作手冊。
全自動液體進樣器使用注意事項：
1、由于進入頂空的載氣同時進入GC，所以用于頂空的氣體也應凈化。
2、頂空瓶加熱溫度，定量管溫度，傳輸線溫度應由小到大，傳輸線小于等于進樣口的溫度
3、應用頂空時，GC氣體總流量應是頂空的氣流加上GC氣流量，計算分流比時應注意。可以用流量計測量后計算。
4、時間設置中，樣品充滿定量管的時間應夠，定量管的平衡時間不應太長，進樣的時間應夠長。
5、壓力調節如果是手動的話，建完方法后應記錄樣品加壓和載氣壓力值，以免由于閥狀態的變化引起壓力變化。
特殊情況下，實驗室人員需要自行安裝全自動液體進樣器上的進樣針，本文就此說下進樣針的安裝方法
1、打開全自動液體進樣器門，向上或向下滑動進樣針支架直至能夠拿取進樣針
2、將針頭穿過針頭基座中的孔，使注射器套管與針芯導槽和注射器夾對準，并將注射器按壓到位，使針頭在針頭基座的孔中。
3、通過沿順時針方向擺動進樣針鎖定銷來關上，然后向下移動針芯支架環，并擰緊針芯螺釘。
4、通過上下滑動滑尺來檢查針頭與基座中的針頭導槽是否對準，針頭應該在針頭導槽中光滑的移動。
5、向下拉動進樣針支架直至針頭支架導槽在進樣口隔墊螺帽頂部附近，針頭支架導槽應該在隔墊防松螺帽的孔上方對中。確保針頭碰到隔墊，而不會在螺帽上摩擦
注意要檢查進樣針針頭是否筆直，針頭支架組件有無安裝錯誤。
